MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermoproteus tenax Kra 1

Total Repeats: 4257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016070	AGG	2	6	65	70	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016070	TTA	2	6	1526	1531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016070	GAG	2	6	2001	2006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016070	CCT	2	6	2024	2029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_016070	GAGGCC	2	12	4113	4124	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016070	ATT	2	6	6116	6121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016070	GGC	2	6	6145	6150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016070	GGC	2	6	6966	6971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016070	CAT	2	6	6983	6988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016070	AGA	2	6	7084	7089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016070	C	6	6	7099	7104	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12	NC_016070	ATC	2	6	7167	7172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016070	ATAA	2	8	7188	7195	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016070	T	6	6	7205	7210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016070	TAAA	3	12	7223	7234	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016070	TAATA	2	10	7253	7262	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016070	TA	3	6	7276	7281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016070	TGA	2	6	7286	7291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016070	AGC	2	6	7382	7387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016070	CGC	2	6	7400	7405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_016070	TCC	2	6	8554	8559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_016070	CTC	2	6	8562	8567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_016070	AGC	2	6	8579	8584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016070	TATC	2	8	8637	8644	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_016070	CGC	2	6	8674	8679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_016070	AG	4	8	8696	8703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016070	GAA	2	6	8737	8742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016070	GGA	2	6	8790	8795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016070	CAT	2	6	8815	8820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016070	TAT	2	6	8871	8876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016070	ATA	2	6	8927	8932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016070	CGC	2	6	10391	10396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_016070	TGG	2	6	10401	10406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016070	CGG	3	9	10425	10433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016070	CA	3	6	10449	10454	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_016070	CCGTGC	2	12	10529	10540	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016070	CCTA	2	8	10592	10599	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_016070	CCT	2	6	10612	10617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_016070	CGG	2	6	10716	10721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016070	CCGC	2	8	10744	10751	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
41	NC_016070	TC	3	6	10845	10850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_016070	AG	4	8	10886	10893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016070	GC	3	6	12294	12299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_016070	TCC	2	6	13673	13678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_016070	TAGCT	2	10	16073	16082	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_016070	CGG	2	6	16163	16168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016070	GTCT	2	8	16267	16274	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_016070	TC	3	6	16782	16787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_016070	ATT	2	6	17941	17946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016070	GGA	2	6	17970	17975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016070	CAG	2	6	18010	18015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016070	G	7	7	18036	18042	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016070	TA	3	6	18062	18067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016070	GCG	2	6	18073	18078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016070	CTGT	2	8	21357	21364	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_016070	GCCG	2	8	21390	21397	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_016070	TCC	2	6	21414	21419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_016070	AGGC	2	8	21497	21504	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_016070	CGC	2	6	21526	21531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_016070	CGC	2	6	21536	21541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_016070	CAGAA	2	10	21576	21585	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_016070	CCG	2	6	22507	22512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_016070	CGC	2	6	22515	22520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_016070	GGGCG	2	10	22523	22532	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
65	NC_016070	CCG	2	6	22541	22546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_016070	GAA	2	6	22612	22617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016070	GGA	2	6	22653	22658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016070	A	6	6	22658	22663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016070	GCC	2	6	22694	22699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_016070	GAC	2	6	22710	22715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016070	CCT	2	6	22749	22754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_016070	GCG	2	6	22763	22768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_016070	TCC	2	6	22818	22823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_016070	T	6	6	22841	22846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016070	CGG	2	6	22852	22857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016070	AATCC	2	10	22890	22899	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_016070	GTC	2	6	22917	22922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016070	GCACGG	2	12	22949	22960	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_016070	GGGC	2	8	22999	23006	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
80	NC_016070	CAACG	2	10	23921	23930	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_016070	TGA	2	6	26126	26131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016070	ATTAT	2	10	26553	26562	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016070	AT	4	8	26561	26568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016070	TA	3	6	26595	26600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016070	AT	3	6	26620	26625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016070	TATT	2	8	26648	26655	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016070	T	6	6	30136	30141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016070	GCG	3	9	30153	30161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016070	T	6	6	30189	30194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016070	TA	3	6	32730	32735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016070	ATAAAA	2	12	34702	34713	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016070	A	6	6	34710	34715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016070	CTC	2	6	39147	39152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_016070	CCTCT	2	10	39153	39162	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
95	NC_016070	CCG	2	6	39178	39183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_016070	AAC	2	6	39198	39203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_016070	TA	3	6	39208	39213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016070	GCC	2	6	39259	39264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_016070	GCC	2	6	39340	39345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_016070	CTC	2	6	39371	39376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_016070	CAT	3	9	39408	39416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_016070	GCCC	2	8	39616	39623	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
103	NC_016070	CCG	2	6	39631	39636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_016070	GC	3	6	40753	40758	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_016070	TAC	2	6	40795	40800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_016070	GAG	2	6	40804	40809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016070	GCG	2	6	40819	40824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_016070	GCC	2	6	40881	40886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_016070	GCC	2	6	40908	40913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_016070	CCG	2	6	40931	40936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_016070	AAT	2	6	41927	41932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016070	ATTA	2	8	41939	41946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016070	TAT	2	6	41979	41984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016070	TAATA	2	10	42008	42017	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016070	T	6	6	42019	42024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016070	AATT	2	8	42037	42044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016070	ATTT	2	8	42063	42070	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016070	T	6	6	42068	42073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016070	AAT	2	6	42082	42087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016070	T	6	6	42089	42094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016070	T	6	6	42887	42892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016070	TGC	2	6	42920	42925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_016070	AGT	2	6	42934	42939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016070	TAA	2	6	50401	50406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016070	TC	3	6	50434	50439	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_016070	ATA	2	6	50440	50445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016070	CTA	2	6	50487	50492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_016070	GCC	2	6	50524	50529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_016070	CGG	2	6	50543	50548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_016070	CGG	2	6	50566	50571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_016070	CGG	2	6	50620	50625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_016070	TCT	2	6	50659	50664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_016070	TGT	2	6	50686	50691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016070	GCG	2	6	50733	50738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_016070	TTAT	2	8	55638	55645	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016070	AGT	2	6	55669	55674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016070	CCG	2	6	55769	55774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_016070	AGG	2	6	55801	55806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016070	GTC	2	6	55823	55828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_016070	C	6	6	56879	56884	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
141	NC_016070	TCC	2	6	56919	56924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_016070	GCCA	2	8	57444	57451	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_016070	CGG	2	6	57524	57529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_016070	GCG	2	6	58687	58692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_016070	TCC	2	6	59999	60004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_016070	AAG	2	6	60068	60073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016070	GC	3	6	60079	60084	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_016070	T	6	6	60087	60092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_016070	CG	3	6	60167	60172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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289	NC_016070	GGTG	2	8	142860	142867	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_016070	CGT	2	6	143210	143215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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434	NC_016070	TCC	2	6	222947	222952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
435	NC_016070	TGT	2	6	222977	222982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
436	NC_016070	CTC	2	6	222984	222989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
437	NC_016070	TAG	2	6	222994	222999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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440	NC_016070	AGA	2	6	223131	223136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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442	NC_016070	CCT	3	9	225398	225406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
443	NC_016070	TCG	2	6	225591	225596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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447	NC_016070	CCT	2	6	225775	225780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
448	NC_016070	AGA	2	6	225960	225965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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450	NC_016070	CGA	2	6	226111	226116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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452	NC_016070	AT	3	6	226332	226337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_016070	CCG	2	6	226373	226378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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457	NC_016070	GCC	2	6	226741	226746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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459	NC_016070	TTG	2	6	226906	226911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_016070	CGG	2	6	226965	226970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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463	NC_016070	GT	3	6	227040	227045	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
464	NC_016070	GCC	2	6	227060	227065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
465	NC_016070	CCG	2	6	227068	227073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
466	NC_016070	ACG	2	6	227083	227088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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468	NC_016070	ACG	2	6	227170	227175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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470	NC_016070	GT	3	6	227270	227275	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
471	NC_016070	TGG	2	6	227323	227328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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492	NC_016070	CGG	2	6	228363	228368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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